Obstaja več raziskav, ki navajajo, da je spočetje otrok s pomočjo podprte reprodukcije povečano tveganje za zaplete različnih vrst, kot so prezgodaj zgodaj, majhna teža ali različne prirojene nepravilnosti pri otroku. Trenutno verjetnost trpljenja teh tveganj ni tako pomembna, da ne bi še naprej uporabljali te metode.
Teoretično so ti neželeni učinki posledica uporabljenih tehnik, to je tveganje z eno ali drugo tehniko večje, kot je oploditev in vitro ali intracitoplazmatska injekcija sperme (ICSI).
Zdaj pa se špekulira o tem težava je lahko v genetiki staršev in ne v isti tehniki. Očitno sta največ vpliv na te spremembe starost staršev in težava sterilnosti.
Da bi to preverili, je bila izvedena študija "Tehnologija podprtega razmnoževanja in prirojene strukturne pomanjkljivosti obravnave v ZDA", v kateri so bili analizirani zdravstveni kartoni 9.584 otrok, rojenih s prirojeno okvaro, in 4.792 zdravih otrok. 230 oziroma 51 je bilo zasnovano s pomočjo reprodukcije.
Ugotovili so, da obstaja zlasti pri nekaterih okvarah, kot so spremembe srčnega septuma, razcepitev ustnice in okvare prebavil, dvakrat večje tveganje za pojav, kadar se uporablja asistirano razmnoževanje, in celo do štirikrat v primeru atrezije požiralnika ali anorekta.
Kljub temu povečanju je verjetnost, da boste imeli prirojeno napako, še vedno majhna, zato lahko nadaljujete z uporabo teh metod, ki vedno opozarjajo na povečano tveganje.
Med 1 in 4 odstotki otrok, rojenih v razvitih državah, to počne zaradi teh tehnik, število pa se povečuje zaradi trenutnega porasta težav s plodnostjo.
